13.05.2021

Создан новый революционный механизм редактирования генома без необходимости разрезать ДНК



«Мы решили, что ретроны должны давать нам возможность производить одноцепочечные ДНК внутри клеток, вместо того, чтобы пытаться заставить их проникнуть в клетку извне. Мы также избегаем повреждений нативной ДНК, что значительно облегчает задачу», — пояснил Дэниел Гудман, соавтор исследования.

У новой системы есть и другие преимущества. Она хорошо масштабируется, позволяя производить миллионы мутаций одновременно, а доля отредактированных клеток фактически увеличивается с течением времени по мере репликации клеток. Последовательность ретрона также можно отслеживать как «штрих-код», что позволяет ученым легко проверять, какие клетки получили какие изменения, при попытке изучить эффекты мутаций.

Чтобы протестировать систему, исследователи применили ее к редактированию популяций кишечной палочки. Они использовали ретроны, чтобы ввести в бактерии гены устойчивости к антибиотика. После ряда других настроек, предназначенных чтобы помешать микробам исправить изменения ДНК (которые бактерия, естественно, посчитает «ошибкой»), ученые обнаружили, что более 90% микробов в среде включили желаемую последовательность в свой естественный геном всего через 20 поколений! А благодаря штрих-кодам ретронов команда смогла легко отследить, какие изменения привели к переносу нужных генов в бактериальный геном.

Хотя предстоит еще много работы, команда уверена, что новый инструмент RLR может иметь множество приложений. В краткосрочной перспективе он может позволить изучать бактериальные геномы и их мутации, потенциально помогая создавать новые полезные штаммы или раскрывать варианты решения таких проблем, как устойчивость к антибиотикам. В долгосрочной перспективе он также может привести к созданию более безопасной альтернативы CRISPR для других организмов, включая нас с вами.



Источник

Поделиться

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *