В новом исследовании, опубликованном 15 января в журнале Molecular Cell, Лакс и его коллеги опубликовали ролики о РНК, используя экспериментальные данные и компьютерный алгоритм. Цель состояла в том, чтобы подробнее рассмотреть, как формируется РНК для лучшего понимания базовой биологии клетки и для того, чтобы лучше подбирать терапию для связанных с этим процессом заболеваний.
Чтобы увидеть, как клетки формируют эту РНК, команда использовала химические вещества, чтобы приостановить процесс «строительства». Когда к РНК добавлялись новые нуклеотиды, исследователи делали паузу, а затем записывали, как эти нуклеотиды взаимодействовали с другими, уже входившими в состав, и какие формы все они образовывали вместе.
Собрав данные от множества отдельных молекул РНК, команда визуализировала их в изображения того, как РНК обычно строит себя во времени. Эти «снимки» служили отдельными кадрами в том, что впоследствии стало финальным роликом образования РНК. Специальный алгоритм, по сути, объединил отдельные кадры в мини-фильмы и заполнил промежутки между кадрами с наиболее вероятными взаимодействиями нуклеотидов.
Предполагается, что SNP-РНК имеет характерную форму, напоминающую шпильку. По мере того, как к последовательности добавляется больше нуклеотидов, новые частички естественным путем помогают распутать узел, вытесняя запутавшихся и пойманных в петлю сородичей.
Большой вопрос заключается в том, может ли РНК самостоятельно выпутываться из этих узлов или иногда ей нужны вспомогательные белки, чтобы облегчить процесс. Возможно, некоторые белки действуют как так называемые «шапероны РНК» и помогают придать молекуле ее окончательную форму – но это еще предстоит выяснить.
Discussion about this post